Secara astronomis Desa Kapur terletak pada posisi 00,03’ 00LS dan 109 23’ BT. Desa Kapur terletak tidak jauh dengan Ibukota Kabupaten Kubu Raya sekitar 6,8 km. Sementara jarak tempuhnya dari ibu kota Provinsi Kalimantan Barat, yaitu sekitar 6,2 km dan hanya dapat ditempuh dengan menggunakan transportasi darat dan sungai.
Desa Kapur terletak di Kecamatan Sungai Raya Kabupaten Kubu Raya Provinsi Kalimantan Barat dengan batas wilayah sebagai berikut:
Sebelah Utara : berbatasan dengan Desa Durian Kecamatan Sungai Ambawang
Sebelah Timur : berbatasan dengan Desa Mekar Baru Kec. Sui Raya
Sebelah Selatan: berbatasan dengan Sungai Kapuas Kec. Sui Raya
Sebelah Barat : berbatasan dengan Kota Pontianak Kecamatan Pontianak Timur